1.中性粒细胞缺乏 (粒缺) 伴发热
【共识2】低危且无明显感染灶的患者,如经抗菌药物治疗≥7d未明显好转可考虑在送检血培养的同时送检外周血标本mNGS;高危患者初始经验性治疗72~96h无效时,推荐送检传统微生物学检测的同时送检血液mNGS。
2.血流感染 (BSI)
【共识3】疑似BSI患者,在留取血培养标本的同时留取血浆样本,于-80℃暂存;如72h内血培养阴性且抗感染治疗无改善的患者,推荐将留存样本进行mNGS。疑似脓毒症的重症患者,建议送检血培养同时送检血mNGS。
3.下呼吸道感染
【共识4】下呼吸道感染患者首选支气管肺泡灌洗液 (BALF) 送检传统微生物学检测,难以进行支气管肺泡灌洗的患者,可以选择深部痰进行检测,并同时留取标本冻存。如抗感染治疗≥72h感染症状无好转或影像学表现持续加重的患者,建议送检留存标本行mNGS检测。如为重症下呼吸道感染或有快速进展为重症的危险因素患者,建议同时送检传统微生物学检测及mNGS。
鉴于血液病患者肺部感染病原谱广,部分病原难以培养或传统检测不能覆盖,且混合感染常见,推荐对于经验性抗感染治疗无效及重症下呼吸道感染患者在完善传统微生物学检测的同时,采用BALF mNGS进行病原诊断。
血液mNGS对于下呼吸道感染病原诊断效果局限。
4.中枢神经系统感染 (CNSI)
【共识5】疑似CNSI,推荐脑脊液在送检传统微生物学检测的同时送检mNGS,在流程上建议选择DNA检测,仅在考虑RNA病毒感染时完善RNA检测流程。
CNSI时外周血与脑脊液病原分离现象 (脑脊液存在感染病原,而外周血不能检出) 并不少见。因此,对于疑似CNSI患者,不推荐外周血作为替代样本进行mNGS检测。
5.肠道或腹腔感染
【共识6】疑似肠道感染患者推荐首选传统微生物学检测,粪便样本病原mNGS 检测可作为补充。疑似腹腔感染,首选感染部位样本送检,如不能获得感染部位样本可选择血液样本送检,但检出性能有限,不作为常规推荐。
对于腹腔感染,如患者已进展为脓毒症休克,推荐首选血液样本mNGS,而相对症状较轻的患者可以选择腹水或血液样本送检。
6.皮肤软组织感染
【共识7】推荐对累及深部或播散性的皮肤软组织感染患者,在完善感染部位标本传统微生物学检测的同时送检mNGS,如不能获得感染灶局部样本,可选择外周血。
皮肤软组织是血液病患者感染常见的累及部位,这类感染容易继发播散,同时也可为播散性感染的表现之一。mNGS对于皮肤软组织感染的优势在于阳性率高、覆盖谱广及对混合感染的识别能力强。在送检时,应首选局部样本,其病原检出率高于血液样本。对于播散性感染,在不能获得局部样本时可选择外周血作为替代或根据临床具体情况选择感染部位以及血液样本平行送检。
7.泌尿系统感染
【共识8】对于复杂性泌尿系统感染、移植后泌尿系统感染在完善传统微生物学检测后不能获得病原学证据或治疗不佳的患者可尝试尿液mNGS。
对于传统微生物检测阴性的泌尿系统感染的患者,可尝试进行尿液mNGS,如感染灶在肾脏,首选穿刺采集组织送检。